Свежие структуры белок-лиганд из PDB в браузере Perplexity Comet
Исследователь одной командой попросил браузер Perplexity Comet найти в PDB три последних комплекса белка GSK3B с лигандом и открыть их в режиме Ligand Interaction. Браузер открыл три структуры, но действительно ли они самые свежие, в посте не проверено.
Что сделали
В браузере Comet от Perplexity исследователь одной фразой попросил найти в PDB три самых свежих комплекса белка GSK3B с лигандом и показать их в режиме Ligand Interaction. Comet нашёл структуры, открыл каждую в отдельной вкладке и сам переключил вид.
Что получилось
Три структуры открылись в отдельных вкладках и были готовы к анализу. В посте названы 8QJI и 8AUZ, третья не указана. Проверки, что это действительно самые свежие структуры, нет.
На что обратить внимание
По словам автора, для всех функций Comet нужна подписка Perplexity Max за $20 в месяц.
Пояснение
PDB (Protein Data Bank) это открытая база трёхмерных структур белков и других биомолекул. GSK3B это белок из семейства киназ, а комплекс с лигандом показывает, как с белком связывается небольшая молекула.
Кому пригодится
Исследователям и студентам в структурной биологии и разработке лекарств, которые часто ищут структуры в PDB.
Попробуйте сами с Perplexity Comet
Найди в Protein Data Bank [число] последних опубликованных структур [белок, например GSK3B] в комплексе с лигандом. Открой каждую в режиме Ligand Interaction и дай по каждой PDB ID, название лиганда, разрешение и ссылку. Остановись, когда все будут открыты.
Нужна помощь с запуском? Вступайте в сообщество AI Pack ↗
Источник: hdpharm.substack.com ·